会计学专业于1983年开始招生，是南京审计大学最早设立的专业之一，是国家首批一流专业建设点、教育部首批新文科项目建设专业、江苏省首批课程思政示范专业、江苏省产教融合型品牌专业、江苏省国际化人才培养品牌专业。会计学专业拥有“高级财务会计”等3门国家级一流本科课程，“财务管理”等4门省级一流本科课程，“会计学”为教育部课程思政示范课程。在“2023软科中国大学专业排名”中，会计学专业属于A类，位列34名（前5%，全国开设学校679所）。本专业人才培养质量得到社会高度认可，就业竞争力位居同类高校前列。

经过多年的探索，本专业已经形成国内学历与国外学历相结合，产学协同、合作育人的特色人才培养模式。为了适应信息技术时代的会计发展，会计学专业进行了智能化改造，学生系统掌握会计学专业理论知识、大数据分析与智能技术，具有国际视野与跨文化交流能力，能够从事财务共享、智能财务与会计决策、会计鉴证、内部控制以及管理咨询等工作。

财务管理本科专业开设于1997年，2012年被遴选为江苏省“十二五”重点专业类——工商管理类专业，2020年获批国家一流专业建设点。在“2023软科中国大学专业排名”中，财务管理专业属于A类，位列31名（前4.1%，全国开设学校757所）。本专业人才培养质量高，据独立第三方调查报告显示，专业毕业生就业相关度、对母校和专业满意度均在90%以上，就业竞争力位居同类高校前列。

为了适应新时代的挑战，培养能够适应信息技术发展需要的优秀财务人才，本专业进行了全面的智能化改造，培养的学生具有强烈社会责任意识、创新精神和国际视野，系统掌握了财务专业知识、大数据分析与智能技术，能够在企事业单位从事财务数据分析、风险管控和管理咨询等工作。

会计学（中澳合作项目）是南京审计大学与澳大利亚科廷大学（Curtin University, Australia）以“3+1”的模式联合培养国际创新型会计人才的本 科教育项目，项目始于2004年，2010年8月，教育部批准南京审计大学与澳大利亚科廷大学合作举办会计学专业本科教育项目（MOE32AU2A20101002N），2013年和2019年通过教育部组织的项目评估。2016年中澳合作项目获批江苏省首批中外合作办学高水平示范性 建设工程项目，2020年通过验收并获评“十三五”江苏高校中外合作办学 高水平示范性建设工程。2022年以中澳合作项目为依托，会计学专业获批江苏高校国际化人才培养品牌专业建设项目。中澳合作项目已经毕业的17届学生中，共1035名学生同时获得了南京审计大学管理学学士和科廷大学商学学士学位。其中775名毕业生被英国布里斯托大学，澳大利亚国立大学、墨尔本大学、悉尼大学 等国际知名高校录取为硕士研究生。硕士研究生入读人数较多的高校包括悉尼大学、新南威尔士大学、澳大利亚国立大学、莫纳什大学和昆士兰大学等全球排名50以内的名校。