武汉生物工程学院于2012年、2018年先后通过教育部本科教学工作合格评估、审核评估，是湖北省唯一一所通过本科教学合格评估和审核评估的民办高校。2025年学校将接受教育部新一轮教育教学审核评估。

教学评估是教育行政主管部门依据一定的教育目标和标准，通过系统地收集学校的主要信息和材料，进行科学分析，对评估对象和办学条件、管理水平、教学质量、办学效益等方面所反映的办学水平的综合评价，并为改进学校工作提供依据。目前，国家教育部在全国开展针对本科高校的教育教学评估工作，目的在于重点检查高校教育教学质量和整体运行情况，加强对高等教育的宏观指导和统筹管理，促进各级政府对高等院校教学工作的重视，改善办学条件，推动高校深化改革。